Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms