Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
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ATP1A4Q13733 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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