Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TUBB3Q13509 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TUBB3Q13509 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TUBB3Q13509 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TUBB3Q13509 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TUBB3Q13509 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TUBB3Q13509 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
TUBB3Q13509 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TUBB3Q13509 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TUBB3Q13509 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TUBB3Q13509 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
TUBB3Q13509 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TUBB3Q13509 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TUBB3Q13509 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TUBB3Q13509 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TUBB3Q13509 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TUBB3Q13509 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TUBB3Q13509 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TUBB3Q13509 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TUBB3Q13509 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TUBB3Q13509 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TUBB3Q13509 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TUBB3Q13509 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TUBB3Q13509 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TUBB3Q13509 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TUBB3Q13509 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TUBB3Q13509 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TUBB3Q13509 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TUBB3Q13509 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TUBB3Q13509 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TUBB3Q13509 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TUBB3Q13509 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TUBB3Q13509 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TUBB3Q13509 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TUBB3Q13509 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TUBB3Q13509 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TUBB3Q13509 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TUBB3Q13509 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TUBB3Q13509 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TUBB3Q13509 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TUBB3Q13509 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
TUBB3Q13509 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TUBB3Q13509 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TUBB3Q13509 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TUBB3Q13509 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TUBB3Q13509 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
TUBB3Q13509 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TUBB3Q13509 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TUBB3Q13509 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TUBB3Q13509 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TUBB3Q13509 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TUBB3Q13509 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TUBB3Q13509 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TUBB3Q13509 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TUBB3Q13509 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TUBB3Q13509 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TUBB3Q13509 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TUBB3Q13509 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TUBB3Q13509 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
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TUBB3Q13509 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
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TUBB3Q13509 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TUBB3Q13509 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TUBB3Q13509 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
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TUBB3Q13509 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
TUBB3Q13509 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
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