Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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SKP2Q13309 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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SKP2Q13309 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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SKP2Q13309 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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SKP2Q13309 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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SKP2Q13309 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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