Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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