Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
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