Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
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