Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

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Length 350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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TWF1Q12792 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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TWF1Q12792 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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TWF1Q12792 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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TWF1Q12792 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
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TWF1Q12792 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
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TWF1Q12792 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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TWF1Q12792 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
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TWF1Q12792 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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TWF1Q12792 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
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