Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms