Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms