Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms