Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms