Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms