Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms