Protein–RNA interactions for Protein: Q00341

HDLBP, Vigilin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBPQ00341 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms