Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COG7P83436 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
COG7P83436 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COG7P83436 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COG7P83436 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COG7P83436 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COG7P83436 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COG7P83436 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COG7P83436 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COG7P83436 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COG7P83436 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COG7P83436 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COG7P83436 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COG7P83436 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COG7P83436 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COG7P83436 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COG7P83436 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COG7P83436 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COG7P83436 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COG7P83436 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COG7P83436 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COG7P83436 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COG7P83436 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COG7P83436 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COG7P83436 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
COG7P83436 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COG7P83436 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COG7P83436 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COG7P83436 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COG7P83436 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
COG7P83436 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COG7P83436 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COG7P83436 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COG7P83436 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COG7P83436 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COG7P83436 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COG7P83436 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COG7P83436 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COG7P83436 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COG7P83436 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COG7P83436 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COG7P83436 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COG7P83436 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COG7P83436 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COG7P83436 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
COG7P83436 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COG7P83436 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COG7P83436 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COG7P83436 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COG7P83436 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COG7P83436 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COG7P83436 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COG7P83436 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COG7P83436 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COG7P83436 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COG7P83436 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COG7P83436 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COG7P83436 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COG7P83436 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COG7P83436 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COG7P83436 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COG7P83436 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COG7P83436 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COG7P83436 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COG7P83436 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COG7P83436 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COG7P83436 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COG7P83436 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COG7P83436 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COG7P83436 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COG7P83436 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COG7P83436 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COG7P83436 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COG7P83436 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COG7P83436 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COG7P83436 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COG7P83436 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COG7P83436 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COG7P83436 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COG7P83436 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
COG7P83436 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
COG7P83436 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COG7P83436 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COG7P83436 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COG7P83436 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COG7P83436 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
COG7P83436 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
COG7P83436 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COG7P83436 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COG7P83436 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COG7P83436 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COG7P83436 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COG7P83436 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COG7P83436 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COG7P83436 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COG7P83436 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COG7P83436 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COG7P83436 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COG7P83436 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
COG7P83436 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms