Protein–RNA interactions for Protein: P78406

RAE1, mRNA export factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAE1P78406 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAE1P78406 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAE1P78406 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAE1P78406 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAE1P78406 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAE1P78406 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAE1P78406 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAE1P78406 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAE1P78406 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAE1P78406 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAE1P78406 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAE1P78406 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAE1P78406 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAE1P78406 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAE1P78406 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAE1P78406 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAE1P78406 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAE1P78406 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAE1P78406 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAE1P78406 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAE1P78406 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAE1P78406 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAE1P78406 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAE1P78406 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAE1P78406 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAE1P78406 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAE1P78406 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAE1P78406 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAE1P78406 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAE1P78406 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAE1P78406 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RAE1P78406 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RAE1P78406 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAE1P78406 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAE1P78406 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAE1P78406 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAE1P78406 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAE1P78406 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAE1P78406 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAE1P78406 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAE1P78406 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAE1P78406 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAE1P78406 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RAE1P78406 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAE1P78406 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAE1P78406 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAE1P78406 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAE1P78406 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAE1P78406 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RAE1P78406 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAE1P78406 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RAE1P78406 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAE1P78406 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAE1P78406 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAE1P78406 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAE1P78406 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAE1P78406 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RAE1P78406 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAE1P78406 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAE1P78406 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAE1P78406 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAE1P78406 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAE1P78406 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAE1P78406 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAE1P78406 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAE1P78406 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAE1P78406 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAE1P78406 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAE1P78406 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RAE1P78406 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAE1P78406 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAE1P78406 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAE1P78406 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAE1P78406 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAE1P78406 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAE1P78406 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAE1P78406 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAE1P78406 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAE1P78406 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAE1P78406 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAE1P78406 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAE1P78406 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAE1P78406 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAE1P78406 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAE1P78406 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAE1P78406 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAE1P78406 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAE1P78406 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAE1P78406 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAE1P78406 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAE1P78406 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAE1P78406 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RAE1P78406 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAE1P78406 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAE1P78406 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RAE1P78406 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAE1P78406 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAE1P78406 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAE1P78406 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAE1P78406 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms