Protein–RNA interactions for Protein: P78396

CCNA1, Cyclin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA1P78396 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNA1P78396 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNA1P78396 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNA1P78396 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNA1P78396 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNA1P78396 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNA1P78396 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNA1P78396 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNA1P78396 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNA1P78396 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNA1P78396 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNA1P78396 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNA1P78396 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNA1P78396 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNA1P78396 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNA1P78396 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNA1P78396 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNA1P78396 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNA1P78396 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNA1P78396 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNA1P78396 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNA1P78396 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNA1P78396 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNA1P78396 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNA1P78396 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNA1P78396 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNA1P78396 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNA1P78396 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNA1P78396 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNA1P78396 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNA1P78396 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNA1P78396 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNA1P78396 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNA1P78396 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNA1P78396 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNA1P78396 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNA1P78396 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNA1P78396 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNA1P78396 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNA1P78396 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNA1P78396 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNA1P78396 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNA1P78396 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNA1P78396 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNA1P78396 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNA1P78396 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNA1P78396 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNA1P78396 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNA1P78396 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNA1P78396 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNA1P78396 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNA1P78396 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNA1P78396 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNA1P78396 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNA1P78396 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNA1P78396 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNA1P78396 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNA1P78396 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNA1P78396 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNA1P78396 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNA1P78396 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNA1P78396 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNA1P78396 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNA1P78396 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNA1P78396 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNA1P78396 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNA1P78396 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNA1P78396 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNA1P78396 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNA1P78396 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNA1P78396 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNA1P78396 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNA1P78396 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNA1P78396 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNA1P78396 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNA1P78396 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNA1P78396 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNA1P78396 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms