Protein–RNA interactions for Protein: P62857

RPS28, 40S ribosomal protein S28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS28P62857 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RPS28P62857 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RPS28P62857 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RPS28P62857 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RPS28P62857 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RPS28P62857 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RPS28P62857 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
RPS28P62857 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RPS28P62857 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RPS28P62857 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RPS28P62857 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RPS28P62857 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RPS28P62857 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RPS28P62857 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RPS28P62857 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RPS28P62857 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RPS28P62857 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RPS28P62857 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RPS28P62857 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RPS28P62857 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RPS28P62857 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RPS28P62857 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RPS28P62857 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RPS28P62857 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RPS28P62857 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RPS28P62857 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RPS28P62857 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RPS28P62857 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RPS28P62857 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RPS28P62857 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RPS28P62857 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RPS28P62857 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RPS28P62857 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RPS28P62857 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RPS28P62857 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPS28P62857 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPS28P62857 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPS28P62857 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPS28P62857 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPS28P62857 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPS28P62857 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
RPS28P62857 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPS28P62857 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPS28P62857 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPS28P62857 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPS28P62857 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPS28P62857 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPS28P62857 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPS28P62857 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
RPS28P62857 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPS28P62857 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPS28P62857 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPS28P62857 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPS28P62857 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPS28P62857 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPS28P62857 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPS28P62857 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPS28P62857 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPS28P62857 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
RPS28P62857 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPS28P62857 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPS28P62857 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPS28P62857 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPS28P62857 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPS28P62857 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPS28P62857 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPS28P62857 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPS28P62857 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPS28P62857 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPS28P62857 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPS28P62857 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPS28P62857 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPS28P62857 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPS28P62857 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPS28P62857 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPS28P62857 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPS28P62857 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPS28P62857 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPS28P62857 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPS28P62857 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPS28P62857 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPS28P62857 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPS28P62857 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPS28P62857 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPS28P62857 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPS28P62857 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPS28P62857 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPS28P62857 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPS28P62857 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPS28P62857 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPS28P62857 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPS28P62857 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPS28P62857 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPS28P62857 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPS28P62857 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPS28P62857 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPS28P62857 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPS28P62857 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPS28P62857 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPS28P62857 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms