Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RPS29P62273 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RPS29P62273 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RPS29P62273 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RPS29P62273 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RPS29P62273 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RPS29P62273 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RPS29P62273 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RPS29P62273 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RPS29P62273 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
RPS29P62273 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RPS29P62273 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RPS29P62273 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RPS29P62273 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RPS29P62273 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RPS29P62273 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RPS29P62273 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RPS29P62273 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RPS29P62273 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RPS29P62273 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RPS29P62273 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RPS29P62273 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RPS29P62273 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RPS29P62273 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RPS29P62273 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RPS29P62273 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RPS29P62273 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RPS29P62273 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RPS29P62273 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RPS29P62273 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RPS29P62273 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RPS29P62273 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RPS29P62273 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RPS29P62273 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RPS29P62273 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RPS29P62273 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RPS29P62273 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RPS29P62273 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RPS29P62273 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
RPS29P62273 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
RPS29P62273 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RPS29P62273 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RPS29P62273 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RPS29P62273 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RPS29P62273 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RPS29P62273 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RPS29P62273 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RPS29P62273 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RPS29P62273 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RPS29P62273 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RPS29P62273 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RPS29P62273 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RPS29P62273 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RPS29P62273 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
RPS29P62273 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPS29P62273 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPS29P62273 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPS29P62273 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPS29P62273 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPS29P62273 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPS29P62273 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPS29P62273 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPS29P62273 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPS29P62273 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPS29P62273 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPS29P62273 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPS29P62273 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPS29P62273 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPS29P62273 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPS29P62273 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPS29P62273 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPS29P62273 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPS29P62273 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPS29P62273 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPS29P62273 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
RPS29P62273 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPS29P62273 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPS29P62273 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPS29P62273 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPS29P62273 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPS29P62273 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPS29P62273 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPS29P62273 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPS29P62273 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPS29P62273 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPS29P62273 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPS29P62273 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPS29P62273 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPS29P62273 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPS29P62273 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPS29P62273 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPS29P62273 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPS29P62273 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
RPS29P62273 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPS29P62273 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPS29P62273 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
RPS29P62273 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPS29P62273 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPS29P62273 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPS29P62273 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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