Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms