Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms