Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms