Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
BACE1P56817 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BACE1P56817 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BACE1P56817 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BACE1P56817 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BACE1P56817 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BACE1P56817 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BACE1P56817 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BACE1P56817 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BACE1P56817 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BACE1P56817 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BACE1P56817 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BACE1P56817 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BACE1P56817 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
BACE1P56817 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BACE1P56817 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BACE1P56817 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BACE1P56817 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
BACE1P56817 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BACE1P56817 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BACE1P56817 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BACE1P56817 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BACE1P56817 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BACE1P56817 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BACE1P56817 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BACE1P56817 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BACE1P56817 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BACE1P56817 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BACE1P56817 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BACE1P56817 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BACE1P56817 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BACE1P56817 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BACE1P56817 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BACE1P56817 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BACE1P56817 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
BACE1P56817 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
BACE1P56817 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BACE1P56817 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BACE1P56817 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BACE1P56817 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BACE1P56817 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BACE1P56817 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BACE1P56817 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BACE1P56817 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BACE1P56817 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BACE1P56817 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BACE1P56817 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BACE1P56817 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BACE1P56817 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BACE1P56817 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BACE1P56817 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BACE1P56817 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BACE1P56817 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BACE1P56817 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BACE1P56817 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BACE1P56817 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BACE1P56817 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BACE1P56817 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BACE1P56817 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BACE1P56817 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BACE1P56817 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BACE1P56817 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BACE1P56817 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BACE1P56817 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BACE1P56817 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BACE1P56817 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
BACE1P56817 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
BACE1P56817 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BACE1P56817 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BACE1P56817 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
BACE1P56817 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BACE1P56817 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BACE1P56817 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BACE1P56817 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BACE1P56817 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BACE1P56817 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
BACE1P56817 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BACE1P56817 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
BACE1P56817 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BACE1P56817 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BACE1P56817 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BACE1P56817 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
BACE1P56817 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BACE1P56817 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BACE1P56817 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BACE1P56817 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BACE1P56817 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BACE1P56817 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BACE1P56817 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BACE1P56817 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BACE1P56817 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BACE1P56817 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BACE1P56817 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BACE1P56817 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BACE1P56817 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BACE1P56817 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BACE1P56817 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BACE1P56817 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BACE1P56817 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BACE1P56817 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms