Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NME5P56597 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NME5P56597 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NME5P56597 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NME5P56597 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NME5P56597 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NME5P56597 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NME5P56597 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NME5P56597 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NME5P56597 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NME5P56597 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NME5P56597 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NME5P56597 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NME5P56597 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NME5P56597 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NME5P56597 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NME5P56597 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NME5P56597 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NME5P56597 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NME5P56597 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NME5P56597 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NME5P56597 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NME5P56597 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NME5P56597 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NME5P56597 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME5P56597 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME5P56597 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME5P56597 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME5P56597 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME5P56597 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME5P56597 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME5P56597 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME5P56597 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME5P56597 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME5P56597 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME5P56597 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME5P56597 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME5P56597 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME5P56597 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NME5P56597 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME5P56597 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME5P56597 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME5P56597 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME5P56597 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME5P56597 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME5P56597 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME5P56597 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME5P56597 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME5P56597 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME5P56597 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME5P56597 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME5P56597 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME5P56597 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME5P56597 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NME5P56597 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NME5P56597 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NME5P56597 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NME5P56597 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NME5P56597 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NME5P56597 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NME5P56597 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NME5P56597 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NME5P56597 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NME5P56597 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NME5P56597 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NME5P56597 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NME5P56597 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NME5P56597 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NME5P56597 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NME5P56597 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NME5P56597 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NME5P56597 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NME5P56597 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NME5P56597 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NME5P56597 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NME5P56597 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NME5P56597 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NME5P56597 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NME5P56597 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NME5P56597 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NME5P56597 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NME5P56597 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NME5P56597 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NME5P56597 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NME5P56597 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NME5P56597 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NME5P56597 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NME5P56597 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NME5P56597 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NME5P56597 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NME5P56597 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NME5P56597 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NME5P56597 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NME5P56597 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NME5P56597 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
NME5P56597 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NME5P56597 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NME5P56597 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NME5P56597 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NME5P56597 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms