Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms