Protein–RNA interactions for Protein: P55899

FCGRT, IgG receptor FcRn large subunit p51, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCGRTP55899 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FCGRTP55899 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FCGRTP55899 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FCGRTP55899 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FCGRTP55899 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FCGRTP55899 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FCGRTP55899 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FCGRTP55899 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FCGRTP55899 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FCGRTP55899 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FCGRTP55899 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FCGRTP55899 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FCGRTP55899 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FCGRTP55899 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FCGRTP55899 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FCGRTP55899 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FCGRTP55899 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FCGRTP55899 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FCGRTP55899 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FCGRTP55899 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FCGRTP55899 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FCGRTP55899 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FCGRTP55899 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FCGRTP55899 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FCGRTP55899 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FCGRTP55899 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FCGRTP55899 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FCGRTP55899 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FCGRTP55899 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FCGRTP55899 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FCGRTP55899 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FCGRTP55899 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FCGRTP55899 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FCGRTP55899 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FCGRTP55899 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FCGRTP55899 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FCGRTP55899 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FCGRTP55899 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FCGRTP55899 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FCGRTP55899 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FCGRTP55899 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FCGRTP55899 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FCGRTP55899 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FCGRTP55899 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FCGRTP55899 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FCGRTP55899 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FCGRTP55899 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FCGRTP55899 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FCGRTP55899 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FCGRTP55899 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FCGRTP55899 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FCGRTP55899 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FCGRTP55899 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FCGRTP55899 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FCGRTP55899 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FCGRTP55899 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FCGRTP55899 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FCGRTP55899 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FCGRTP55899 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FCGRTP55899 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FCGRTP55899 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FCGRTP55899 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FCGRTP55899 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FCGRTP55899 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FCGRTP55899 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FCGRTP55899 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FCGRTP55899 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FCGRTP55899 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FCGRTP55899 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FCGRTP55899 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FCGRTP55899 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FCGRTP55899 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FCGRTP55899 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FCGRTP55899 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FCGRTP55899 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FCGRTP55899 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FCGRTP55899 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FCGRTP55899 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FCGRTP55899 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FCGRTP55899 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FCGRTP55899 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FCGRTP55899 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FCGRTP55899 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FCGRTP55899 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FCGRTP55899 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FCGRTP55899 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FCGRTP55899 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FCGRTP55899 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FCGRTP55899 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FCGRTP55899 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FCGRTP55899 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FCGRTP55899 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FCGRTP55899 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FCGRTP55899 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FCGRTP55899 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FCGRTP55899 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FCGRTP55899 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FCGRTP55899 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FCGRTP55899 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FCGRTP55899 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms