Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASP7P55210 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASP7P55210 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASP7P55210 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASP7P55210 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CASP7P55210 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASP7P55210 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASP7P55210 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASP7P55210 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASP7P55210 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASP7P55210 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CASP7P55210 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASP7P55210 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASP7P55210 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASP7P55210 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASP7P55210 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASP7P55210 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP7P55210 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP7P55210 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP7P55210 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP7P55210 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP7P55210 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP7P55210 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP7P55210 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP7P55210 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP7P55210 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP7P55210 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP7P55210 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP7P55210 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP7P55210 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP7P55210 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP7P55210 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP7P55210 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP7P55210 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP7P55210 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASP7P55210 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASP7P55210 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASP7P55210 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CASP7P55210 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CASP7P55210 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASP7P55210 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASP7P55210 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CASP7P55210 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASP7P55210 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CASP7P55210 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASP7P55210 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASP7P55210 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASP7P55210 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASP7P55210 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASP7P55210 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASP7P55210 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASP7P55210 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASP7P55210 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CASP7P55210 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASP7P55210 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASP7P55210 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASP7P55210 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASP7P55210 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASP7P55210 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASP7P55210 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASP7P55210 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASP7P55210 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASP7P55210 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASP7P55210 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASP7P55210 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASP7P55210 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASP7P55210 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASP7P55210 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASP7P55210 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASP7P55210 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASP7P55210 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASP7P55210 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASP7P55210 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASP7P55210 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASP7P55210 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CASP7P55210 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CASP7P55210 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CASP7P55210 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CASP7P55210 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CASP7P55210 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASP7P55210 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASP7P55210 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASP7P55210 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASP7P55210 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASP7P55210 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASP7P55210 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASP7P55210 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASP7P55210 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASP7P55210 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASP7P55210 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CASP7P55210 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CASP7P55210 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASP7P55210 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASP7P55210 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASP7P55210 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASP7P55210 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASP7P55210 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASP7P55210 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASP7P55210 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASP7P55210 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms