Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms