Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms