Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TGM4P49221 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TGM4P49221 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TGM4P49221 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TGM4P49221 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TGM4P49221 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TGM4P49221 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TGM4P49221 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TGM4P49221 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TGM4P49221 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TGM4P49221 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TGM4P49221 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TGM4P49221 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TGM4P49221 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TGM4P49221 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TGM4P49221 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TGM4P49221 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TGM4P49221 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TGM4P49221 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TGM4P49221 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TGM4P49221 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TGM4P49221 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TGM4P49221 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TGM4P49221 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TGM4P49221 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TGM4P49221 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TGM4P49221 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TGM4P49221 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TGM4P49221 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TGM4P49221 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TGM4P49221 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TGM4P49221 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TGM4P49221 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TGM4P49221 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TGM4P49221 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TGM4P49221 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TGM4P49221 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TGM4P49221 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TGM4P49221 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TGM4P49221 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TGM4P49221 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TGM4P49221 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TGM4P49221 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TGM4P49221 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TGM4P49221 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TGM4P49221 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TGM4P49221 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TGM4P49221 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TGM4P49221 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TGM4P49221 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TGM4P49221 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TGM4P49221 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TGM4P49221 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TGM4P49221 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TGM4P49221 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TGM4P49221 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TGM4P49221 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TGM4P49221 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TGM4P49221 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TGM4P49221 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TGM4P49221 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TGM4P49221 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TGM4P49221 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TGM4P49221 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TGM4P49221 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TGM4P49221 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TGM4P49221 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TGM4P49221 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TGM4P49221 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TGM4P49221 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TGM4P49221 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TGM4P49221 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TGM4P49221 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TGM4P49221 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TGM4P49221 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TGM4P49221 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TGM4P49221 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TGM4P49221 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TGM4P49221 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TGM4P49221 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TGM4P49221 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TGM4P49221 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TGM4P49221 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TGM4P49221 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TGM4P49221 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TGM4P49221 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TGM4P49221 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TGM4P49221 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TGM4P49221 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TGM4P49221 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TGM4P49221 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TGM4P49221 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TGM4P49221 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TGM4P49221 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TGM4P49221 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TGM4P49221 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TGM4P49221 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TGM4P49221 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TGM4P49221 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TGM4P49221 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms