Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRPC1P48995 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms