Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms