Protein–RNA interactions for Protein: P43694

GATA4, Transcription factor GATA-4, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA4P43694 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATA4P43694 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATA4P43694 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATA4P43694 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATA4P43694 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATA4P43694 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATA4P43694 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATA4P43694 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATA4P43694 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATA4P43694 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATA4P43694 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATA4P43694 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATA4P43694 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATA4P43694 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATA4P43694 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATA4P43694 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATA4P43694 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATA4P43694 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATA4P43694 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATA4P43694 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATA4P43694 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATA4P43694 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GATA4P43694 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATA4P43694 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATA4P43694 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATA4P43694 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATA4P43694 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATA4P43694 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GATA4P43694 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GATA4P43694 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GATA4P43694 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GATA4P43694 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GATA4P43694 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GATA4P43694 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GATA4P43694 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GATA4P43694 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GATA4P43694 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GATA4P43694 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GATA4P43694 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GATA4P43694 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GATA4P43694 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GATA4P43694 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GATA4P43694 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GATA4P43694 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GATA4P43694 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GATA4P43694 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GATA4P43694 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GATA4P43694 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GATA4P43694 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
GATA4P43694 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA4P43694 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA4P43694 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA4P43694 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA4P43694 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA4P43694 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA4P43694 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA4P43694 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA4P43694 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA4P43694 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA4P43694 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA4P43694 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA4P43694 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA4P43694 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA4P43694 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA4P43694 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA4P43694 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA4P43694 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA4P43694 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA4P43694 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA4P43694 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA4P43694 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA4P43694 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA4P43694 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA4P43694 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA4P43694 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA4P43694 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATA4P43694 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GATA4P43694 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GATA4P43694 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATA4P43694 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATA4P43694 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATA4P43694 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATA4P43694 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATA4P43694 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATA4P43694 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATA4P43694 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATA4P43694 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GATA4P43694 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATA4P43694 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GATA4P43694 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATA4P43694 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATA4P43694 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATA4P43694 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATA4P43694 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATA4P43694 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATA4P43694 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATA4P43694 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA4P43694 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA4P43694 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA4P43694 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms