Protein–RNA interactions for Protein: P37840

SNCA, Alpha-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCAP37840 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SNCAP37840 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNCAP37840 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNCAP37840 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNCAP37840 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNCAP37840 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNCAP37840 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNCAP37840 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNCAP37840 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNCAP37840 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNCAP37840 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNCAP37840 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNCAP37840 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNCAP37840 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNCAP37840 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNCAP37840 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNCAP37840 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SNCAP37840 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNCAP37840 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNCAP37840 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNCAP37840 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SNCAP37840 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNCAP37840 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNCAP37840 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SNCAP37840 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNCAP37840 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNCAP37840 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNCAP37840 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNCAP37840 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNCAP37840 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNCAP37840 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNCAP37840 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNCAP37840 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNCAP37840 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNCAP37840 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNCAP37840 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNCAP37840 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNCAP37840 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNCAP37840 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNCAP37840 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNCAP37840 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNCAP37840 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNCAP37840 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNCAP37840 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNCAP37840 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNCAP37840 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNCAP37840 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNCAP37840 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNCAP37840 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNCAP37840 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNCAP37840 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNCAP37840 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNCAP37840 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNCAP37840 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNCAP37840 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNCAP37840 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNCAP37840 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNCAP37840 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNCAP37840 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNCAP37840 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNCAP37840 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNCAP37840 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNCAP37840 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNCAP37840 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNCAP37840 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNCAP37840 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNCAP37840 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNCAP37840 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNCAP37840 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNCAP37840 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNCAP37840 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SNCAP37840 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNCAP37840 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNCAP37840 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNCAP37840 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNCAP37840 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNCAP37840 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNCAP37840 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNCAP37840 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNCAP37840 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNCAP37840 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNCAP37840 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNCAP37840 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNCAP37840 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNCAP37840 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNCAP37840 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNCAP37840 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNCAP37840 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNCAP37840 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNCAP37840 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNCAP37840 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNCAP37840 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNCAP37840 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNCAP37840 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNCAP37840 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNCAP37840 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNCAP37840 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNCAP37840 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNCAP37840 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNCAP37840 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms