Protein–RNA interactions for Protein: P35527

KRT9, Keratin, type I cytoskeletal 9, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT9P35527 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
KRT9P35527 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KRT9P35527 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KRT9P35527 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KRT9P35527 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT9P35527 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT9P35527 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT9P35527 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT9P35527 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT9P35527 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT9P35527 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT9P35527 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT9P35527 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT9P35527 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT9P35527 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT9P35527 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT9P35527 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.31■■□□□ 1
KRT9P35527 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT9P35527 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT9P35527 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT9P35527 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT9P35527 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT9P35527 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT9P35527 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT9P35527 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT9P35527 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KRT9P35527 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT9P35527 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT9P35527 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT9P35527 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT9P35527 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT9P35527 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT9P35527 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT9P35527 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KRT9P35527 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KRT9P35527 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KRT9P35527 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KRT9P35527 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT9P35527 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT9P35527 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT9P35527 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT9P35527 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT9P35527 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT9P35527 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KRT9P35527 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT9P35527 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT9P35527 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KRT9P35527 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT9P35527 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT9P35527 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT9P35527 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT9P35527 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT9P35527 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT9P35527 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT9P35527 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT9P35527 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT9P35527 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT9P35527 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT9P35527 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT9P35527 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT9P35527 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT9P35527 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KRT9P35527 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KRT9P35527 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT9P35527 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT9P35527 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT9P35527 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT9P35527 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT9P35527 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT9P35527 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT9P35527 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT9P35527 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT9P35527 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT9P35527 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT9P35527 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT9P35527 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT9P35527 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT9P35527 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT9P35527 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT9P35527 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT9P35527 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT9P35527 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT9P35527 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT9P35527 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT9P35527 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT9P35527 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT9P35527 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KRT9P35527 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT9P35527 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT9P35527 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT9P35527 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT9P35527 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT9P35527 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT9P35527 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT9P35527 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT9P35527 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT9P35527 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KRT9P35527 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KRT9P35527 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRT9P35527 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms