Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPC1P35052 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GPC1P35052 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPC1P35052 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPC1P35052 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPC1P35052 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GPC1P35052 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPC1P35052 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPC1P35052 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPC1P35052 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPC1P35052 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPC1P35052 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPC1P35052 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPC1P35052 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPC1P35052 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPC1P35052 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPC1P35052 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPC1P35052 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPC1P35052 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GPC1P35052 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GPC1P35052 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPC1P35052 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPC1P35052 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPC1P35052 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPC1P35052 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPC1P35052 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPC1P35052 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPC1P35052 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPC1P35052 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPC1P35052 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPC1P35052 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPC1P35052 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPC1P35052 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPC1P35052 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPC1P35052 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPC1P35052 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPC1P35052 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPC1P35052 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPC1P35052 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPC1P35052 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPC1P35052 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPC1P35052 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPC1P35052 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPC1P35052 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPC1P35052 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPC1P35052 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GPC1P35052 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPC1P35052 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPC1P35052 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GPC1P35052 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GPC1P35052 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPC1P35052 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPC1P35052 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPC1P35052 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPC1P35052 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPC1P35052 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPC1P35052 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPC1P35052 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPC1P35052 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPC1P35052 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPC1P35052 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPC1P35052 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPC1P35052 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPC1P35052 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPC1P35052 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPC1P35052 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPC1P35052 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPC1P35052 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPC1P35052 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPC1P35052 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPC1P35052 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPC1P35052 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPC1P35052 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GPC1P35052 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPC1P35052 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GPC1P35052 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPC1P35052 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPC1P35052 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPC1P35052 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPC1P35052 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPC1P35052 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPC1P35052 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPC1P35052 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPC1P35052 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPC1P35052 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPC1P35052 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPC1P35052 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPC1P35052 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPC1P35052 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPC1P35052 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPC1P35052 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPC1P35052 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPC1P35052 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPC1P35052 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPC1P35052 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPC1P35052 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPC1P35052 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPC1P35052 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPC1P35052 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPC1P35052 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms