Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CMPK1P30085 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CMPK1P30085 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CMPK1P30085 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CMPK1P30085 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CMPK1P30085 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CMPK1P30085 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CMPK1P30085 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CMPK1P30085 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CMPK1P30085 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CMPK1P30085 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CMPK1P30085 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CMPK1P30085 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CMPK1P30085 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CMPK1P30085 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CMPK1P30085 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CMPK1P30085 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CMPK1P30085 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CMPK1P30085 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CMPK1P30085 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CMPK1P30085 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CMPK1P30085 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CMPK1P30085 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CMPK1P30085 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CMPK1P30085 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CMPK1P30085 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CMPK1P30085 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CMPK1P30085 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CMPK1P30085 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CMPK1P30085 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CMPK1P30085 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CMPK1P30085 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CMPK1P30085 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CMPK1P30085 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CMPK1P30085 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CMPK1P30085 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CMPK1P30085 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CMPK1P30085 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CMPK1P30085 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CMPK1P30085 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CMPK1P30085 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CMPK1P30085 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CMPK1P30085 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CMPK1P30085 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CMPK1P30085 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CMPK1P30085 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CMPK1P30085 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CMPK1P30085 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CMPK1P30085 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CMPK1P30085 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CMPK1P30085 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CMPK1P30085 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CMPK1P30085 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CMPK1P30085 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CMPK1P30085 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CMPK1P30085 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CMPK1P30085 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CMPK1P30085 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CMPK1P30085 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CMPK1P30085 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CMPK1P30085 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CMPK1P30085 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CMPK1P30085 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CMPK1P30085 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CMPK1P30085 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CMPK1P30085 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CMPK1P30085 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CMPK1P30085 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CMPK1P30085 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CMPK1P30085 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CMPK1P30085 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CMPK1P30085 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CMPK1P30085 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CMPK1P30085 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CMPK1P30085 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CMPK1P30085 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CMPK1P30085 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CMPK1P30085 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CMPK1P30085 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CMPK1P30085 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CMPK1P30085 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CMPK1P30085 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CMPK1P30085 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CMPK1P30085 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CMPK1P30085 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CMPK1P30085 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CMPK1P30085 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CMPK1P30085 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CMPK1P30085 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms