Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms