Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM5AP29375 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM5AP29375 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM5AP29375 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM5AP29375 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM5AP29375 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM5AP29375 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM5AP29375 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM5AP29375 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM5AP29375 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM5AP29375 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM5AP29375 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM5AP29375 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM5AP29375 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM5AP29375 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM5AP29375 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM5AP29375 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM5AP29375 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM5AP29375 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM5AP29375 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM5AP29375 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM5AP29375 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM5AP29375 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM5AP29375 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM5AP29375 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM5AP29375 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM5AP29375 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM5AP29375 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM5AP29375 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM5AP29375 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM5AP29375 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM5AP29375 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM5AP29375 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM5AP29375 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM5AP29375 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM5AP29375 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM5AP29375 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM5AP29375 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM5AP29375 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM5AP29375 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM5AP29375 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM5AP29375 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM5AP29375 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM5AP29375 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM5AP29375 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM5AP29375 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM5AP29375 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM5AP29375 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM5AP29375 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM5AP29375 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM5AP29375 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
KDM5AP29375 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.08
KDM5AP29375 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM5AP29375 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM5AP29375 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM5AP29375 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM5AP29375 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM5AP29375 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM5AP29375 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM5AP29375 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM5AP29375 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM5AP29375 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM5AP29375 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KDM5AP29375 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KDM5AP29375 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
KDM5AP29375 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
KDM5AP29375 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC28■■■□□ 2.07
KDM5AP29375 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
KDM5AP29375 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
KDM5AP29375 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
KDM5AP29375 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC28■■■□□ 2.07
KDM5AP29375 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
KDM5AP29375 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
KDM5AP29375 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KDM5AP29375 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KDM5AP29375 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KDM5AP29375 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KDM5AP29375 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC28■■■□□ 2.07
KDM5AP29375 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KDM5AP29375 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KDM5AP29375 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KDM5AP29375 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KDM5AP29375 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM5AP29375 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM5AP29375 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM5AP29375 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM5AP29375 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM5AP29375 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM5AP29375 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM5AP29375 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM5AP29375 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM5AP29375 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM5AP29375 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM5AP29375 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM5AP29375 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM5AP29375 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM5AP29375 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM5AP29375 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM5AP29375 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM5AP29375 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms