Protein–RNA interactions for Protein: P26599

PTBP1, Polypyrimidine tract-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTBP1P26599 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.444e-6■■■■■ 30.9
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PTBP1P26599 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.064e-14■■■■■ 30.8
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PTBP1P26599 COMMD1-208ENST00000472729 629 ntTSL 314.8□□□□□ -0.041e-7■■■■■ 30.8
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PTBP1P26599 LRRFIP1-212ENST00000483443 1069 ntTSL 39.56□□□□□ -0.881e-7■■■■■ 30.8
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PTBP1P26599 FOXO3-203ENST00000540898 2553 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.951e-7■■■■■ 30.8
PTBP1P26599 CEPT1-207ENST00000480324 2110 ntTSL 28.99□□□□□ -0.971e-7■■■■■ 30.8
PTBP1P26599 SBF2-201ENST00000256190 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.061e-7■■■■■ 30.8
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PTBP1P26599 FAM13A-218ENST00000511976 3579 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.161e-7■■■■■ 30.8
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PTBP1P26599 YLPM1-204ENST00000549197 2085 ntTSL 1 (best)7.11□□□□□ -1.274e-14■■■■■ 30.8
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PTBP1P26599 HACE1-206ENST00000517995 2809 ntTSL 1 (best)6.45□□□□□ -1.381e-7■■■■■ 30.8
PTBP1P26599 MTA2-203ENST00000526844 627 ntTSL 36.42□□□□□ -1.384e-14■■■■■ 30.8
PTBP1P26599 LINC00969-328ENST00000630663 746 ntTSL 56.41□□□□□ -1.381e-7■■■■■ 30.8
PTBP1P26599 AC233280.20-201ENST00000637412 416 ntBASIC6.33□□□□□ -1.41e-7■■■■■ 30.8
PTBP1P26599 CEPT1-206ENST00000478042 2175 ntTSL 56.08□□□□□ -1.441e-7■■■■■ 30.8
PTBP1P26599 ANKHD1-EIF4EBP3-202ENST00000474060 5446 ntTSL 25.65□□□□□ -1.51e-7■■■■■ 30.8
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