Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTNNA2P26232 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTNNA2P26232 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTNNA2P26232 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTNNA2P26232 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTNNA2P26232 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTNNA2P26232 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTNNA2P26232 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTNNA2P26232 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTNNA2P26232 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTNNA2P26232 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTNNA2P26232 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTNNA2P26232 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTNNA2P26232 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTNNA2P26232 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTNNA2P26232 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTNNA2P26232 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTNNA2P26232 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTNNA2P26232 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CTNNA2P26232 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTNNA2P26232 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTNNA2P26232 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTNNA2P26232 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTNNA2P26232 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CTNNA2P26232 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTNNA2P26232 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTNNA2P26232 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTNNA2P26232 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTNNA2P26232 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTNNA2P26232 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTNNA2P26232 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTNNA2P26232 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms