Protein–RNA interactions for Protein: P24821

TNC, Tenascin, humanhuman

Predictions only

Length 2,201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNCP24821 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNCP24821 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNCP24821 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNCP24821 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNCP24821 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNCP24821 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNCP24821 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNCP24821 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNCP24821 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TNCP24821 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNCP24821 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNCP24821 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNCP24821 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNCP24821 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNCP24821 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNCP24821 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNCP24821 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNCP24821 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TNCP24821 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TNCP24821 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TNCP24821 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNCP24821 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNCP24821 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNCP24821 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNCP24821 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNCP24821 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNCP24821 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNCP24821 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNCP24821 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNCP24821 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNCP24821 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNCP24821 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNCP24821 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNCP24821 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNCP24821 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNCP24821 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNCP24821 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNCP24821 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNCP24821 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNCP24821 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNCP24821 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNCP24821 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNCP24821 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNCP24821 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNCP24821 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNCP24821 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNCP24821 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNCP24821 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNCP24821 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNCP24821 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNCP24821 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNCP24821 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNCP24821 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNCP24821 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNCP24821 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNCP24821 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNCP24821 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNCP24821 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNCP24821 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNCP24821 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNCP24821 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNCP24821 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNCP24821 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNCP24821 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TNCP24821 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNCP24821 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNCP24821 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TNCP24821 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNCP24821 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNCP24821 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNCP24821 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNCP24821 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNCP24821 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNCP24821 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNCP24821 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNCP24821 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNCP24821 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNCP24821 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNCP24821 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNCP24821 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNCP24821 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNCP24821 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNCP24821 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TNCP24821 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNCP24821 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNCP24821 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNCP24821 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNCP24821 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNCP24821 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNCP24821 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNCP24821 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNCP24821 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNCP24821 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNCP24821 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNCP24821 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNCP24821 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNCP24821 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNCP24821 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNCP24821 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNCP24821 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms