Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD247P20963 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD247P20963 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD247P20963 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CD247P20963 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD247P20963 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD247P20963 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD247P20963 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD247P20963 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD247P20963 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD247P20963 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD247P20963 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD247P20963 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD247P20963 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD247P20963 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CD247P20963 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CD247P20963 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CD247P20963 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CD247P20963 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CD247P20963 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CD247P20963 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CD247P20963 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CD247P20963 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CD247P20963 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CD247P20963 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CD247P20963 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CD247P20963 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CD247P20963 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CD247P20963 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CD247P20963 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CD247P20963 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CD247P20963 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CD247P20963 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CD247P20963 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CD247P20963 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CD247P20963 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CD247P20963 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CD247P20963 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CD247P20963 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CD247P20963 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CD247P20963 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CD247P20963 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CD247P20963 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CD247P20963 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CD247P20963 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CD247P20963 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CD247P20963 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CD247P20963 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CD247P20963 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CD247P20963 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CD247P20963 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CD247P20963 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CD247P20963 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CD247P20963 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CD247P20963 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CD247P20963 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CD247P20963 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CD247P20963 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CD247P20963 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CD247P20963 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CD247P20963 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CD247P20963 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CD247P20963 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CD247P20963 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CD247P20963 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CD247P20963 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CD247P20963 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD247P20963 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD247P20963 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD247P20963 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD247P20963 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD247P20963 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD247P20963 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD247P20963 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD247P20963 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD247P20963 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD247P20963 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD247P20963 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD247P20963 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD247P20963 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD247P20963 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD247P20963 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD247P20963 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD247P20963 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD247P20963 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD247P20963 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD247P20963 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD247P20963 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CD247P20963 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD247P20963 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD247P20963 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD247P20963 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD247P20963 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD247P20963 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CD247P20963 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD247P20963 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CD247P20963 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD247P20963 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD247P20963 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD247P20963 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms