Protein–RNA interactions for Protein: P20851

C4BPB, C4b-binding protein beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BPBP20851 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms