Protein–RNA interactions for Protein: P20849

COL9A1, Collagen alpha-1(IX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A1P20849 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COL9A1P20849 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
COL9A1P20849 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms