Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms