Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms