Protein–RNA interactions for Protein: P16562

CRISP2, Cysteine-rich secretory protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP2P16562 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRISP2P16562 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRISP2P16562 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRISP2P16562 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRISP2P16562 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRISP2P16562 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRISP2P16562 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRISP2P16562 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRISP2P16562 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRISP2P16562 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRISP2P16562 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRISP2P16562 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRISP2P16562 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRISP2P16562 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRISP2P16562 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRISP2P16562 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRISP2P16562 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRISP2P16562 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRISP2P16562 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRISP2P16562 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRISP2P16562 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRISP2P16562 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRISP2P16562 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRISP2P16562 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRISP2P16562 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRISP2P16562 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRISP2P16562 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CRISP2P16562 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRISP2P16562 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRISP2P16562 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRISP2P16562 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CRISP2P16562 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRISP2P16562 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRISP2P16562 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRISP2P16562 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRISP2P16562 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRISP2P16562 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRISP2P16562 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRISP2P16562 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRISP2P16562 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CRISP2P16562 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRISP2P16562 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRISP2P16562 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRISP2P16562 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRISP2P16562 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRISP2P16562 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRISP2P16562 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRISP2P16562 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRISP2P16562 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRISP2P16562 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRISP2P16562 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRISP2P16562 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRISP2P16562 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRISP2P16562 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRISP2P16562 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRISP2P16562 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRISP2P16562 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRISP2P16562 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRISP2P16562 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRISP2P16562 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRISP2P16562 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRISP2P16562 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRISP2P16562 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRISP2P16562 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CRISP2P16562 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CRISP2P16562 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CRISP2P16562 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CRISP2P16562 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRISP2P16562 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRISP2P16562 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CRISP2P16562 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRISP2P16562 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CRISP2P16562 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CRISP2P16562 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CRISP2P16562 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CRISP2P16562 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRISP2P16562 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRISP2P16562 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRISP2P16562 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRISP2P16562 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRISP2P16562 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRISP2P16562 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRISP2P16562 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CRISP2P16562 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CRISP2P16562 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CRISP2P16562 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRISP2P16562 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CRISP2P16562 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CRISP2P16562 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRISP2P16562 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CRISP2P16562 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CRISP2P16562 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRISP2P16562 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRISP2P16562 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRISP2P16562 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CRISP2P16562 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRISP2P16562 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CRISP2P16562 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRISP2P16562 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRISP2P16562 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms