Protein–RNA interactions for Protein: P14314

PRKCSH, Glucosidase 2 subunit beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCSHP14314 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKCSHP14314 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKCSHP14314 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKCSHP14314 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKCSHP14314 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKCSHP14314 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKCSHP14314 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKCSHP14314 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKCSHP14314 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKCSHP14314 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKCSHP14314 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKCSHP14314 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKCSHP14314 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKCSHP14314 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKCSHP14314 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKCSHP14314 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKCSHP14314 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKCSHP14314 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKCSHP14314 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKCSHP14314 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKCSHP14314 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKCSHP14314 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKCSHP14314 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKCSHP14314 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKCSHP14314 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKCSHP14314 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKCSHP14314 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKCSHP14314 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKCSHP14314 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKCSHP14314 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKCSHP14314 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKCSHP14314 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKCSHP14314 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKCSHP14314 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKCSHP14314 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRKCSHP14314 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRKCSHP14314 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRKCSHP14314 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRKCSHP14314 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRKCSHP14314 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRKCSHP14314 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRKCSHP14314 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRKCSHP14314 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKCSHP14314 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKCSHP14314 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKCSHP14314 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKCSHP14314 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKCSHP14314 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKCSHP14314 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKCSHP14314 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKCSHP14314 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKCSHP14314 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKCSHP14314 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKCSHP14314 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKCSHP14314 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKCSHP14314 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKCSHP14314 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKCSHP14314 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKCSHP14314 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKCSHP14314 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKCSHP14314 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKCSHP14314 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKCSHP14314 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKCSHP14314 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKCSHP14314 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKCSHP14314 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKCSHP14314 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKCSHP14314 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKCSHP14314 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKCSHP14314 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKCSHP14314 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKCSHP14314 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKCSHP14314 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKCSHP14314 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKCSHP14314 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKCSHP14314 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKCSHP14314 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKCSHP14314 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKCSHP14314 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKCSHP14314 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKCSHP14314 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKCSHP14314 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKCSHP14314 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKCSHP14314 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKCSHP14314 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKCSHP14314 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKCSHP14314 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKCSHP14314 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKCSHP14314 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKCSHP14314 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKCSHP14314 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKCSHP14314 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKCSHP14314 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKCSHP14314 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKCSHP14314 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKCSHP14314 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKCSHP14314 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKCSHP14314 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKCSHP14314 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKCSHP14314 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms